通過基因工程方法的改造，促進新型菌株的構(gòu)建和傳統(tǒng)菌株的改造，全面促進微生物工業(yè)時代的來臨。到那時，土壤不再是黑箱，而是一個可以看得見的、摸得著的系統(tǒng)，在許多年以來土壤微生物學(xué)家所面臨諸多問題就可以解決了。土壤管理者可根據(jù)實際情況，通過各種措施，有目的的調(diào)理土壤微生物數(shù)目和種類，制定農(nóng)業(yè)生產(chǎn)措施；也可以根據(jù)土壤微生物客觀條件制定耕作制度。通過改進施肥、栽培制度、人為引入有益的土壤微生物等措施，來恢復(fù)原有的微生物群落或增加某些功能，從而抑制作物土傳病菌、提高土壤微生物多樣性，有助于土壤生態(tài)肥力的提高，從根本上防治作物土傳病害、連作障礙。人類對微生物功能的利用將更能“隨心所欲”了。